La storia si svolge in un universo parallelo (la A.N.I.V.E.R.S.E.), dove è in corso una guerra tra la Federazione del Regno Animale (gestito da mammiferi) con a capo Bucky (una lepre verde) e il sinistro Impero di Rospo. L'Impero di Rospo è guidato da un vasto sistema informatico noto come K.O.M.P.L.E.X., che ha fatto il lavaggio del cervello alla popolazione. Un giorno Willy, un ragazzo esperto di informatica, si trova catapultato in questo universo tramite un portale e decide di unirsi all'equipaggio di Bucky nella lotta contro i nemici.
