La storia è ambientata a Tokyo nell'anno 1909, sul finire dell'epoca Meiji. Il duo protagonista è costituito da un letterato, Kyōsuke Kindaichi, e un giovane poeta sregolato di nome Takuboku Ishikawa. Dopo essersi ritrovati coinvolti in un misterioso assassinio, i due fondano un'agenzia investigativa privata. Da qui iniziano le indagini su alcune misteriose apparizioni di fantasmi nell'edificio Asakusa Juunikai.
