Questo è un mondo dove esistono sia mostri che umani. Coloro che cacciano i mostri vengono chiamati Cacciatori… ma in un piccolo angolo del mondo dei Cacciatori ci sono i Riders, persone che creano un rapporto coi mostri. Ryuto è un giovane ragazzo che vive ad Hakum, un villaggio di Rider ed il suo più grande sogno è quello di diventare il miglior Rider al mondo. Avendo appena compiuto 12 anni comincia la sua avventura, lascia la sua città e cerca il suo Otomon, prima della cerimonia nella quale riceverà il suo Kizuna Ishi. Insieme a Shuval, suo docile amico d’infanzia, Lilia, anche lei una sua compagnia d’infanzia e anche molto curiosa, ed infine il suo compagno Naviloo entra nella foresta ed ha un incredibile contro con Rathalos. La storia inizia proprio quando il Rider ed il suo Otomon appofondiscono il loro legame.
